En voici le concept de la série :

Après avoir gagner la guerre sur Terre et remit le Spark de l'original Mégatron, TF G1, que Mégatron, de Beast Wars, avait prit pour devenir plus puissant, les Maximals retournent sur Cybertron vers leur époque ,le futur très lointain, en traversant un vortex espace-temps avec une navette de secours des Autobots qui ce trouvait dans l'Arch avec Mégatron comme prisonnier. En route, Mégatron s'échappe de la navette et est propulsé sur Cybertron avant les Maximals à leur époque. Mégatron désactive la population entière, Autobots, Décepticons, Maximals et Prédacons, avec un virus, leur retire leur Spark et prend contrôle de Cybertron. Il se construit une armée nommé Véhicons. Les Maximals arrivent ensuite et sont attaqués par les Véhicons et à l'aide du virus ils détransmétallisent les Maximals et reprenne le première forme, saison 1, bloque leur transformation et leur font perdre la mémoire. Fuyant, ils rencontreront l'Oracle, Vector Sigma, et elle les reforme en mi-robots mi-organique. Ils ne se transforment plus, ils mutent. Avec leur nouvelle apparence, ils devront délivrer la population de Cybertron, de l'emprise de Mégatron et ses Généraux Véhicons et ramener l'ordre sur Cybertron.